宏基因组测序( Metagenome)

宏基因组( Metagenome)：（也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组）是由 Handelsman等1998年提出的，其定义为“ the genomes of the total microbiota found in nature”, 即环境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和不可培养的微生物的基因，目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。

宏基因组不依赖于微生物的分离培养，克服了传统的纯培养方法的技术限制，并可研究不可培养的微生物。可以得到环境中丰度较低的，甚至是微量微生物的信息，为研究低丰度微生物提供了途径。

宏基因组学引入了宏观生态的研究理念，对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究，可以更准确地反应出微生物生存的真实状态。